Vest for og langs med banesporet ligger Højen station, en gulmalet længe med teglhængt heltag med halvvalme. I den søndre gavis forlængelse er en udbygning, ligeledes med tegihængt, halvvalmet heltag. Stationsbygningen anvendes nu kun til beboelse, og et venteskur i glasfiber er opstillet til de rejsende.

Over den fremspringende sokkel fremtræder murværket stænkpudset og plastikmalet gult. Langsiderne afsluttes mod tag af en hvidmalet gesims med to retkantede led, mod øst over et hvidmalet hånd. Tagrender af zink. Taget er lagt med røde, håndstrøgne vingetegl med hvidtet kantforskælling. Symmetrisk på tagryggen er to hvide skorstenspiber med sokkel og udkragning. Midt i den søndre tagflade er en lille pladebeklædt taskekvist, mod nord er tre ovenlysvinduer. Vinduerne er malet mørkegrønne. Det er 2- og 3-fags krydspostvinduer med 4- rudede undetrammer og i-rudede overtammer. Vinduesfalsene er hvidmalede ligesom de spinkle, støbte sålhænke. Indgang mod nord af en nyere listebeklædt, grønmalet dør med rude og overvindue. På vestsiden anes bygningens karakter før Plesners ombygning, bl.a. viser murværkets hamborgfugning at huset har stået i blank mur og stikkene angiver vinduernes placering.
Udbygningen ved sydgavlen har en tilbagetrukket venteplads; foran denne er en brolagt plads, som er skærmet af lave, gulmalede mure med sortmalet, støbt afdækning.

Gårdsrummet vest for huset er belagt med betonfliser, brosten og teglsten. Parallelt med hovedhuset er her et lille gulmalet udhus med udhængende teglhængt heltag. På tagryggen, yderst ved sydgavlen, er en hvidmalet skorstenspibe med sokkel og udkragning. Udhuset har en rødmalet revledør og et grønmalet 2- rammet vindue med tre rudet i hver ramme. I den gulmalede mur, der forbinder de to huse, er en rødmalet revielåge med svungen overkant.

Haven er afgrænset af sortbejdset plankeværk og raftehegn. Ud mod skinnerne står et galvaniseret trådhegn. Syd for stationen ligger et godspakhus med rødmalet, lodretstående træbeklædning, prydet med hvidmalede brystningslister, gavltrekanter, vindskeder og udskårne spærhoveder samt fint udskårne indfatninger omkring portene midt på hver langside. Disse skydeporte er beklædt med brædder i sildebensmønster. Heltaget er beklædt med grå bølgeeternit. Huset står på en høj betonsokkel, langs siderne er en grusbelagt rampe. I haven er desuden et nyere træskur med paptag.

Højen Station er idag Naturhistorisk Museum Skagen